Maja Lilja är doktor i sociologi och forskar om frågor som rör etnicitet, migration, segregation och klimat. Hon disputerade 2015 med avhandlingen "Det bästa för mitt barn: Nyblivna mödrar i den delade staden" som handlar om hur nyblivna mödrar ser på sina barns uppväxt i förhållande till etnicitet, klass och kön. Under 2022–2023 hade hon en postdok inom det strategiska forskningsområdet ”Hållbar stadsutveckling”.
Maja undervisar på kurser i sociologi, samhällsvetenskaplig teori och kvalitativ metod på socionom- och PA-programmet.